По отношению к субстрату и факторам окружающей среды лишайники подразделяют на ряд экологических групп. Различают лишайники, растущие на почве, деревьях, камнях и других субстратах, которых насчитывается свыше 200. Основное условие поселения лишайников — длительная неподвижность субстрата. Трофические (пищевые) связи, вероятно, не имеют большого значения, хотя известны группы лишайников, предпочитающие субстраты с определенными химическими свойствами.
Среди эпигейных (напочвенных) лишайников различают кочующие-формы, у которых связь с почвой практически отсутствует и они переносятся ветром (например, пармелия блуждающая — Parmelia vagans, аспицилия съедобная — Aspicitia esculenta и др.), и постоянно прикрепленные формы. Последние поселяются на бедных питательными веществами почвах (песчаных, торфянистых и т. п.), малопригодных для развития других растений. Огромные пространства тундр и лесотундр покрыты лишайниками, среди которых преобладают виды кладония — Cladonia, кладина — Cladina, алектория — Alectoria, цетра-рия — Cetraria, стереокаулон — Stereocauton и др. Обычна охролехия виннокаменная — Ochroleuchia tartarea, обрастающая беловатой корочкой мхи и другие растения. В лесах эпигейные лишайники встречаются в редколесье и на опушках, где обычны виды Cladonia, Cladina, пельтигера — Peltigera и др. В сухих борах-беломошниках развит лишайниковый покров из кустистых лишайников. На замшелых отмерших стволах деревьев в лесах северной и умеренной зон флора лишайников близка к флоре напочвенных лишайников и представлена видами Cladonia, Cladina, Peltigera, беомицес — Baeomyces, Cetraria, нефро-ма — Nephroma и др. Эпигейные лишайники, развивающиеся в «пустынях и полупустынях, обычно представлены накипными формами, хорошо различимыми лишь во влажный период года.
Эпифитные лишайники, растущие на стволах и ветвях деревьев и кустарников, включают накипные, кустистые и листоватые формы. Среди накипных имеются гипофлеодные виды, слоевища которых развиваются под корой, и эпифлеодные, слоевища которых произрастают на коре. Среди лишайников рода графис — Graphis есть виды с гипофлеодными и эпифлеодными слоевищами. Эпифлеодное слоевище характерно для графиса письменного—G. scripta, развивающегося на гладкой коре многих древесных пород. К наиболее распространенным эпифитным кустистым и листоватым лишайникам относятся виды Parmelia, Hypogymnia, фисция — Physcia, Evernia, Cetraria, Usnea и др. Имеется некоторая приуроченность разных видов лишайников к древесным породам и частям деревьев (основанию, средней и верхней части стволов и ветвям). Ведущие факторы адаптации к этим условиям — физические и химические свойства коры, освещенность и влажность. Во влажных условиях горных ущелий эпифитные лишайники затрудняют доступ воздуха к коре, способствуют накоплению влаги и являются приютом для насекомых и грибов, многие из которых разрушают древесину. Возможен переход эпифит-ных лишайников с коры на мелкие веточка-листья и хвою (например, Н. physodes может развиваться и на хвое елей).
Экологические группы лишайников