Самый внутренний слой первичной коры, отделяющий ее от глубже расположенного центрального цилиндра, представляет собой эндодерму, встречающуюся в корнях почти всех растений. Она состоит из одного, реже из двух рядов клеток, образующих в поперечном разрезе кольцо. Клетки эндодермы корня подобно стеблю в большинстве случаев имеют полосы Каспари. Эндодерма в корне выражена более четко, чем в надземном стебле. Нередко стенки ее клеток опробковевают и значительно утолщаются, иногда весьма неравномерно, в результате чего образуются, например, так называемые V- или U-образные клетки. Такое строение эндодермы особенно характерно для однодольных. У многих голосеменных и двудольных эндодерма сбрасывается вместе с корой, когда в перицикле, расположенном под ней, развивается перидерма.
Перицикл, или перикамбий, следующий за эндодермой, является наружным слоем центрального цилиндра. У многих однодольных и некоторых двудольных он однорядный, реже состоит из нескольких рядов клеток; у голосеменных — обычно многорядный. Клетки пе-рицикла периодически делятся и дают начало боковым корням (поэтому его еще называют корнеродным слоем), а также паренхиме, млечникам, пробковому камбию и частично настоящему камбию, у корнеотпрысковых растений, кроме того, — придаточным почкам.
Центральный цилиндр в корне развит слабее, чем первичная кора. Проводящая часть состоит из чередующихся групп ксилемы и флоэмы, расположенных на поперечном срезе но кругу, чем корень первичного строения резко отличается от стебля первичного строения, в котором ксилема и флоэма супротивны. Между группами проводящих элементов проходят сердцевинные лучи, расположена паренхима, которая входит и в состав групп проводящих элементов. В первичной ксилеме снаружи находятся узкие спиральные и кольчатые трахеи-ды — протоксилема, а ближе к центру более крупные точечные, лестничные и сетчатые сосуды — метаксилема. Такое расположение сосудов является результатом их экзархного (центростремительного) образования, что типично для корня. Сосуды ксилемных групп корня большей частью смыкаются в центре, и тогда последний занят одним или несколькими крупными сосудами; в этом случае сердцевина отсутствует. Однако ксилемные группы могут и не смыкаться в центральной части корня, которая тогда представляет собой сердцевину, состоящую из тонкостенных паренхимных клеток, В ней могут проходить млечники и смоляные ходы. В случае наличия сердцевины пучки первичной ксилемы располагаются по ее периферии, в концах первичных сердцевинных лучей; по этому признаку также можно отличить корень от стебля.
Корни различаются по количеству ксилемных групп, с одной группой — монархные, с двумя группами — диархные, с тремя —? триархные, с четырьмя — тетрархные, с большим количеством групп — полиархные. Число ксилемных групп является характерным, хотя и не всегда, для крупных систематических групп растений.
Самый внутренний слой первичной коры